Từ khi thành lập, Viện đã tích cực hợp tác cùng với đội ngũ nghiên cứu khoa học từ các đơn vị của Trường Đại học Quy Nhơn. Chúng tôi tập trung hợp tác nghiên cứu trong các lĩnh vực thế mạnh như: công nghệ thông tin; công nghệ GIS và viễn thám; lĩnh vực nông nghiệp công nghệ cao; xử lý môi trường; bảo quản các sản phẩm nông sản, thuỷ sản theo các tiêu chuẩn quốc tế để xuất khẩu;…
Đặc biệt, với sản phẩm Hệ thống phần mềm Lưu trữ, truyền nhận và xử lý hình ảnh y tế (QNPACS); Hệ thống phần mềm Quản lý và khai thác dữ liệu xét nghiệm trong y tế (QNLIS) được ứng dụng và chuyển giao thành công tại một số đơn vị y tế, bệnh viện như: Trung tâm y tế thị xã An Nhơn, Bệnh viện Lao và bệnh phổi Bình Định, BVĐK tỉnh Bình Định, BVĐK tỉnh Phú Yên, BVĐK An Phước (Bình Thuận), BV Quốc tế Becamex (Bình Dương), BVĐK tỉnh Bình Phước, BVĐK TP. Buôn Ma Thuột.
Ngoài ra, Viện còn hợp tác và triển khai Hệ thống phần mềm quản lý bảo tàng và trưng bày ảo với Bảo tàng Đắk Lắk và Bảo tàng Quang Trung (tỉnh Bình Định).